Žižkova kasárna se nachází na území ochranného pásma městské památkové rezervace UNESCO a jsou součástí historické zástavby města. Ačkoliv je fasáda budovy historicky cenná, není objekt dokončený před více jak 120 lety kulturní nemovitou památkou. V rámci rekonstrukce bude fasáda citlivě obnovena a celá stavba bude i nadále v souladu s charakterem území. Kromě kanceláří a zázemí pro zaměstnance v kasárnách po dokončení památkáři počítají i s depozitáři, knihovnou, archivem, badatelnou, multifunkčním sálem a návštěvnickým centrem.
Například na fasádě opravami projdou ornamenty a šambrány, restaurátorské práce se dotknou různých erbů, mříží či vstupních dveří, které se musí zachovat. Vedle restaurátorských prací úpravami projdou vnitřní dispozice, budova získá i zcela novou střechu, vytápění zajistí geotermální vrty. Celá akce je financována z rozpočtu Ministerstva kultury České republiky, program SMVS Rozvoj a obnova materiálně technické základny státních kulturních zařízení. Žižkova kasárna od Města Kroměříž koupil (za symbolické čtyři koruny) v roce 2020 Národní památkový ústav, který je příspěvkovou organizací Ministerstva kultury. Po jejich opravě se sem přestěhují obě kroměřížská pracoviště NPÚ. Jedno spravuje státní památky na Moravě a ve Slezsku, druhé se zabývá památkovou péčí ve Zlínském kraji.